MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Blattabacterium sp. (Blatta orientalis) str. Tarazona plasmid

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020196	AAGG	2	8	17	24	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020196	C	10	10	43	52	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_020196	A	7	7	68	74	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020196	AGAA	2	8	79	86	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020196	TC	4	8	92	99	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020196	GGGGGA	2	12	136	147	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020196	T	7	7	178	184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020196	ATT	3	9	187	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020196	ACTTT	2	10	204	213	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020196	A	7	7	234	240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020196	A	6	6	251	256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020196	A	7	7	275	281	100 %	0 %	0 %	0 %	444335883
13	NC_020196	T	7	7	303	309	0 %	100 %	0 %	0 %	444335883
14	NC_020196	A	7	7	325	331	100 %	0 %	0 %	0 %	444335883
15	NC_020196	GAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
16	NC_020196	TTTA	2	8	362	369	25 %	75 %	0 %	0 %	444335883
17	NC_020196	A	7	7	375	381	100 %	0 %	0 %	0 %	444335883
18	NC_020196	AAG	2	6	399	404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
19	NC_020196	AGCAA	2	10	427	436	60 %	0 %	20 %	20 %	444335883
20	NC_020196	AGT	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444335883
21	NC_020196	AGA	2	6	484	489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
22	NC_020196	AGA	2	6	492	497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
23	NC_020196	CAT	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335883
24	NC_020196	A	7	7	531	537	100 %	0 %	0 %	0 %	444335883
25	NC_020196	TTC	2	6	546	551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335883
26	NC_020196	AAC	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335883
27	NC_020196	A	7	7	584	590	100 %	0 %	0 %	0 %	444335883
28	NC_020196	TA	3	6	592	597	50 %	50 %	0 %	0 %	444335883
29	NC_020196	CAA	2	6	621	626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020196	A	6	6	625	630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020196	CTAC	2	8	635	642	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020196	ACAA	2	8	651	658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020196	A	7	7	657	663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020196	TC	3	6	674	679	0 %	50 %	0 %	50 %	444335884
35	NC_020196	AAT	2	6	698	703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335884
36	NC_020196	AT	3	6	752	757	50 %	50 %	0 %	0 %	444335884
37	NC_020196	TAA	2	6	769	774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335884
38	NC_020196	ATC	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335884
39	NC_020196	T	6	6	811	816	0 %	100 %	0 %	0 %	444335884
40	NC_020196	GAAG	2	8	834	841	50 %	0 %	50 %	0 %	444335884
41	NC_020196	T	8	8	854	861	0 %	100 %	0 %	0 %	444335884
42	NC_020196	ATC	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335884
43	NC_020196	A	6	6	901	906	100 %	0 %	0 %	0 %	444335884
44	NC_020196	T	6	6	934	939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020196	ATTTT	2	10	951	960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020196	T	7	7	972	978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020196	CATC	2	8	1047	1054	25 %	25 %	0 %	50 %	444335885
48	NC_020196	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444335885
49	NC_020196	ATA	2	6	1119	1124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335885
50	NC_020196	GAG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	444335885
51	NC_020196	A	6	6	1325	1330	100 %	0 %	0 %	0 %	444335885
52	NC_020196	ATA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335885
53	NC_020196	GAATG	2	10	1377	1386	40 %	20 %	40 %	0 %	444335885
54	NC_020196	CTC	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444335886
55	NC_020196	AAAATA	2	12	1432	1443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335886
56	NC_020196	AT	3	6	1454	1459	50 %	50 %	0 %	0 %	444335886
57	NC_020196	TA	3	6	1461	1466	50 %	50 %	0 %	0 %	444335886
58	NC_020196	ATTTT	2	10	1477	1486	20 %	80 %	0 %	0 %	444335886
59	NC_020196	CATT	2	8	1504	1511	25 %	50 %	0 %	25 %	444335886
60	NC_020196	T	6	6	1538	1543	0 %	100 %	0 %	0 %	444335886
61	NC_020196	AAT	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
62	NC_020196	T	10	10	1606	1615	0 %	100 %	0 %	0 %	444335886
63	NC_020196	ATCATA	2	12	1647	1658	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	444335886
64	NC_020196	ATA	2	6	1660	1665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
65	NC_020196	TCA	2	6	1697	1702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335886
66	NC_020196	AAT	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
67	NC_020196	AACTA	2	10	1722	1731	60 %	20 %	0 %	20 %	444335886
68	NC_020196	CAA	2	6	1758	1763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335886
69	NC_020196	AT	3	6	1789	1794	50 %	50 %	0 %	0 %	444335886
70	NC_020196	TTC	2	6	1798	1803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335886
71	NC_020196	A	7	7	1806	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	444335886
72	NC_020196	ACA	2	6	1828	1833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335886
73	NC_020196	ATA	2	6	1838	1843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
74	NC_020196	A	6	6	1880	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020196	TTA	3	9	1893	1901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
76	NC_020196	TAT	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
77	NC_020196	AACA	2	8	1954	1961	75 %	0 %	0 %	25 %	444335887
78	NC_020196	T	7	7	2001	2007	0 %	100 %	0 %	0 %	444335887
79	NC_020196	TTA	2	6	2022	2027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
80	NC_020196	TTG	2	6	2066	2071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	444335887
81	NC_020196	AT	3	6	2086	2091	50 %	50 %	0 %	0 %	444335887
82	NC_020196	TCA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335887
83	NC_020196	CA	4	8	2209	2216	50 %	0 %	0 %	50 %	444335887
84	NC_020196	TTCC	2	8	2234	2241	0 %	50 %	0 %	50 %	444335887
85	NC_020196	ATT	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
86	NC_020196	A	6	6	2276	2281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020196	TCC	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_020196	C	6	6	2295	2300	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_020196	T	6	6	2363	2368	0 %	100 %	0 %	0 %	444335888
90	NC_020196	T	7	7	2387	2393	0 %	100 %	0 %	0 %	444335888
91	NC_020196	GAA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335888
92	NC_020196	A	7	7	2479	2485	100 %	0 %	0 %	0 %	444335888
93	NC_020196	TCTG	2	8	2486	2493	0 %	50 %	25 %	25 %	444335888
94	NC_020196	A	7	7	2566	2572	100 %	0 %	0 %	0 %	444335888
95	NC_020196	TC	3	6	2603	2608	0 %	50 %	0 %	50 %	444335888
96	NC_020196	CT	4	8	2626	2633	0 %	50 %	0 %	50 %	444335888
97	NC_020196	ATTC	2	8	2682	2689	25 %	50 %	0 %	25 %	444335888
98	NC_020196	TTC	2	6	2722	2727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335888
99	NC_020196	TTTC	2	8	2733	2740	0 %	75 %	0 %	25 %	444335888
100	NC_020196	A	6	6	2817	2822	100 %	0 %	0 %	0 %	444335888
101	NC_020196	CTG	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444335888
102	NC_020196	AAAG	2	8	2864	2871	75 %	0 %	25 %	0 %	444335888
103	NC_020196	AGA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335888
104	NC_020196	AAC	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335888
105	NC_020196	GCT	3	9	2909	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444335888
106	NC_020196	CTT	2	6	2933	2938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335888
107	NC_020196	TCC	2	6	2945	2950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444335888
108	NC_020196	TTA	2	6	2951	2956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335888
109	NC_020196	CATC	2	8	2982	2989	25 %	25 %	0 %	50 %	444335888
110	NC_020196	CAT	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335888
111	NC_020196	A	6	6	3026	3031	100 %	0 %	0 %	0 %	444335888
112	NC_020196	GCT	2	6	3077	3082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444335888
113	NC_020196	CAT	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335888
114	NC_020196	AAT	2	6	3168	3173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335888
115	NC_020196	TTCTGT	2	12	3181	3192	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	444335888
116	NC_020196	AT	3	6	3210	3215	50 %	50 %	0 %	0 %	444335888
117	NC_020196	ATTT	2	8	3280	3287	25 %	75 %	0 %	0 %	444335888
118	NC_020196	TTG	2	6	3310	3315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	444335888
119	NC_020196	CAT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335888
120	NC_020196	CTAA	2	8	3388	3395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020196	A	6	6	3447	3452	100 %	0 %	0 %	0 %	444335889
122	NC_020196	GC	5	10	3576	3585	0 %	0 %	50 %	50 %	444335889
123	NC_020196	TA	3	6	3609	3614	50 %	50 %	0 %	0 %	444335889
124	NC_020196	TAA	3	9	3623	3631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335889
125	NC_020196	TAA	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335889
126	NC_020196	AT	3	6	3650	3655	50 %	50 %	0 %	0 %	444335889
127	NC_020196	G	11	11	3690	3700	0 %	0 %	100 %	0 %	444335889

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.